无论乳糜泻、肠局部炎症、溃疡结肠炎、憩室炎、小肠细菌过度生长等肠道疾病通常都与微生物有关。肠道有数万亿微生物，数量、菌类会改变，可能好的菌变少、坏菌多，有人说药喂好的菌就持纤维，于是一天吃11份谷物，其中至少3份全谷物。然而全谷物中纤维只有7%，其他都是淀粉，不是高纤维。谷物中含植酸，阻挡矿物质、捆绑矿物质，会使身体缺乏铁、锌、钙、镁，植酸是阻碍营养吸收。平常看到谷物包装上标注的营养丰富，是添加合成维生素，因为精制谷物在加工过程已经流失营养。谷物中蛋白质是麸质，会破坏肠道导致出现问题，即便没有麸质过敏，也可能会较敏感的情况。

        一般人都会想到通过吃纤维来预防便秘，达到排便通畅。纤维类型多，例如谷物、沙拉菜。沙拉菜有大量纤维，没有麸质，植酸少，除了菠菜这类含有草酸盐和多的植酸。建议选择吃沙拉菜，营养更丰富，有钾、镁、叶酸、维生素C。有些生酮点心加了功能性纤维，如水溶性玉米纤维、木薯纤维、菊糖（inulin）、菊苣根（chicory root）等，很多人吃了这些成分产品会腹胀、胀气。当结肠产生腹胀、胀气，是因为食物在微生物作用下发酵，微生物分解纤维，释放大量甲烷和其他气体，导致结肠膨胀和疼痛。

        肠道菌大致分3类：1、坏菌，也就是病原体；2、益菌，益生菌，与身体是互惠关系；3、中性微生物，是共生者，住在身体里，不会伤害也不会有帮助，不打扰身体正常运作。问题是肠道大量微生物是可以改变其性质，中性菌变成有害菌。有坏处的菌都不是无中生有，是中性菌转变成坏菌。

        当肠道环境改变，大肠杆菌、幽门螺旋杆菌、艰难梭状芽孢杆菌、念珠菌这些菌会转变，开始制造麻烦。肠道改变有七个因素：1、肠道压力；2、吃抗生素，即使没有吃抗生素，但吃小麦、谷物都含有喷洒了农药除草剂，这些都可归类为抗生素。草甘膦农药，是抗生素，杀死土壤微生物，也能杀死肠道菌。因此谷物的不好之处除了植酸、麸质，还有人添加的抗生素。3、药物；4、垃圾食物；5、酒精；6、人造甜味剂。

        要修复肠道问题，需要认知这些肠道菌的重要性，微生物种类数量多，生存能力很强，可以适应很恶劣的环境，可以活在海底、云端、熔岩，而且我们依赖它们存在。肠道菌对免疫很重要，可以帮助身体制造维生素、助消化，提供有益健康的次要化合物。

        快速自我测试肠道有没有疾病的方法：

        不吃所有纤维3天，自我观察去感受身体。之后把纤维加回去饮食当中，吃3天。然后进行比较：不吃纤维的3天感觉和后面吃纤维3天的感觉，吃和不吃的差异。可以确认是否有肠道问题或是否有发炎、肠道菌群失衡。

结果：1、先不吃纤维的那些天感觉更好，是肠道有问题。要先暂时停止吃纤维。

          2、是后面吃了纤维的那些天感觉更好，肠道没有问题。因为微生物分解到纤维得到满足。

        这样自我测试方法省掉去医院的检查或内视镜的折磨。推荐的纤维食物是植物纤维，例如沙拉蔬菜。然后疑问来了，微生物没有纤维会死掉吗？纤维是微生物唯一食物吗？事实上肠道菌能适应任何状况，可以吃任何东西，微生物甚至靠金属、塑料、体内废物都能存活。即使小肠细菌过度生长，好菌还是吃纤维、蛋白质等其他营养。当身体无法适应纤维，也就是吃了纤维感觉肠胃不适时就不能吃纤维。吃发酵食物，例如酸菜（sauerkraut）、泡菜（kimchi）比纤维更好。不吃纤维一段时间之后想把纤维加回饮食中，建议吃发酵纤维，如酸菜、泡菜类。

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